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现场报码室研讨追溯八倍体栽培草莓的二倍体先人
发布日期:2020-10-16 14:01   来源:未知   阅读:

东亚是野生草莓的多样性分布中央,其中大局部二倍体草莓及所有四倍体草莓均散布于中国。自2017年,中国科学院华南植物园植物迷信研究核心与江苏省农科院果树所配合,发展3个二倍体草莓(绿色草莓、黄毛草莓F.nilgerrensis和西藏草莓F.nubicola)染色体级别的全基因序列组装,联合已发表的高质量的森林草莓及饭沼草莓基因组,基于比拟基因组学研究发明二倍体草莓基因组形成高度守旧。在重建草莓属基因组系统发育的基础上,推测该属构成时光约为6.37百万年。各基因组之间存在强烈的基因渐渗和不完全谱系分选。这能够说明为什么基于系统发育策略来推测八倍体草莓祖先,不同的团队基于同套数据,王中王论坛www5059o9com,采取不同的参数或办法会得出不同的结论。研究职员采用最近开发的方式,直接未来自73个栽培草莓样本的重测序序列分离比对到由5个二倍体草莓重构的参考基因组序列,确认森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓的二倍体祖先,而绿色草莓、黄毛草莓和西藏草莓则不是二倍体祖先。该研究策略无需基于体系发育关联,因此可有效防止基因渐渗和不完整谱系分选所带来的影响,研究结果解决了当前对于栽培八倍体草莓二倍体祖先的些争议,香港现场报码中国空军近日组织轰-6K、苏-35等多型。同时,丹参的这四大主要功效,两类人群特别需要!,该研究取得的3个高品质二倍体基因组为草莓基因组资源挖掘和分子育种奠定了基本。

追溯八倍体栽培草莓的二倍体先人

相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上,华南动物园博士冯超和江苏省农科院果树所博士王静为论文共同第作者,华南植物园研究员康明和江苏省农科院果树所研究员赵密珍为论文独特通信作者。研究工作得到中科院策略性先导科技专项(A类)和科技部重点研发项目标赞助。

古代栽培草莓(Fragaria × ananassa)是18世纪中期在法国由来自北美的八倍体弗吉尼亚草莓(F.virginiana)跟来自南美的八倍体智利草莓(F.chiloensis)偶尔杂交而成的异源八倍体。目前已成为寰球广为栽培的生果。然而,对其二倍体祖先的争辩连续半个多世纪,至今未解决。Edger等在Nature Genetics上发表的八倍体草莓基因组论文(Edger et al., 2019, 51: 541?547)揣测其有4个不同的二倍体祖先,分辨是森林草莓(F.vesca)、饭沼草莓(F.iinumae)、绿色草莓(F.viridis)和日本草莓(F.nipponica)。Liston等实现统套数据的从新剖析,却得到不同的结论,以为八倍体草莓只有两个现存的祖先,即森林草莓和饭沼草莓,相干研讨作为Nature Genetics 2020年首篇论文发表(Liston et al., 2020, 52: 2?4)。Nature Genetics登载了Edger等的回答,表现保持此前的论断(Edger et al., 2020, 52: 5?7)。这两篇NG论文互指对方分析中的不足,使栽培草莓的二倍体来源之谜错综复杂,并进入民众视线。